最主要的區別是截留的分子量不同

納濾膜：截留有機物的分子量大約為150-500左右，截留溶解性鹽的能力為2-98%之間，對單價陰離子鹽溶液的脫鹽低于高價陰離子鹽溶液。

RO膜：可阻擋所有溶解的無機分子以及任何相對分子質量大于100的有機物，水分子可通過薄膜成為純水，對水中二價離子的脫除率可達99.5%，對一價離子的脫除率也在95%以上。